安徽医科大学资产经营公司成立于2015年10月，是代表安徽医科大学对外投资、管理和运营学校经营性资产、规范学校经营行为的管理型公司，是代表学校对所属企业行使出资人权利的机构。公司主要职责有：
1、贯彻执行国家法律法规和上级部门有关校办企业的方针政策；
2、完善校办企业的管理制度，受校国有资产管理委员会委托，负责学校已剥离的经营性资产经营管理事务，直接行使所有者职能；
3、建立以资本为纽带、产权明晰、权责明确、政企分开、管理科学的现代企业内部法人结构。依法自主经营、自负盈亏、照章纳税，承担国有资产保值增值主体责任；
4、代表学校对所属企业享有出资人的权利和行使所有者职能，通过控股、参股的股东大会和派出董事、监事参与企业的管理和监督，并对企业进行投资和依法转让国有股；
5、积极参与学校科技成果机制改革，并承担科技成果的转化实施；
6、完成学校交办的其它工作。